Details for gene set V$LHX3

Table: GSEA Results Summary

Dataset	RNR_GSEA_DESEQ2_FC
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	V$LHX3_01
Enrichment Score (ES)	0.17015417
Normalized Enrichment Score (NES)	2.9123447
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	9.745293E-5
FWER p-Value	0.001

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CGA	37	3.339	0.0026	Yes
2	DSPP	69	2.486	0.0056	Yes
3	GRM5	156	1.783	0.0055	Yes
4	KRT32	237	1.385	0.0058	Yes
5	SYTL5	252	1.349	0.0097	Yes
6	WNT9A	278	1.269	0.0130	Yes
7	PCDH10	351	1.095	0.0137	Yes
8	LEMD1	372	1.060	0.0172	Yes
9	HRK	388	1.032	0.0210	Yes
10	TMIGD1	480	0.932	0.0207	Yes
11	GABRG1	533	0.850	0.0225	Yes
12	LRP2	617	0.755	0.0226	Yes
13	FGF19	661	0.714	0.0249	Yes
14	NPR3	709	0.673	0.0270	Yes
15	KLF14	732	0.650	0.0305	Yes
16	IRX6	759	0.635	0.0337	Yes
17	OFCC1	802	0.615	0.0360	Yes
18	KRTAP11-1	897	0.570	0.0355	Yes
19	KCNS1	945	0.549	0.0376	Yes
20	CDKL5	1079	0.492	0.0350	Yes
21	SULF1	1190	0.441	0.0337	Yes
22	FEV	1222	0.434	0.0366	Yes
23	CNBD1	1273	0.416	0.0385	Yes
24	PDZRN4	1275	0.415	0.0431	Yes
25	OLFM4	1347	0.388	0.0439	Yes
26	PRDM1	1351	0.387	0.0484	Yes
27	MED12L	1422	0.364	0.0492	Yes
28	SP6	1436	0.359	0.0531	Yes
29	ARNTL	1606	0.326	0.0486	Yes
30	CFB	1631	0.322	0.0519	Yes
31	CLRN1	1658	0.318	0.0551	Yes
32	OTX2	1672	0.316	0.0590	Yes
33	DCX	1703	0.311	0.0620	Yes
34	ALDH1A1	1747	0.302	0.0643	Yes
35	FAM19A1	1947	0.267	0.0582	Yes
36	TFAP2A	1968	0.265	0.0617	Yes
37	PRKG1	2040	0.257	0.0625	Yes
38	COLEC10	2099	0.251	0.0640	Yes
39	DIXDC1	2130	0.247	0.0670	Yes
40	CHN2	2252	0.233	0.0650	Yes
41	RORA	2270	0.231	0.0687	Yes
42	DMD	2280	0.230	0.0729	Yes
43	ANGPT1	2293	0.229	0.0768	Yes
44	DDX6	2302	0.228	0.0810	Yes
45	HHIP	2327	0.226	0.0844	Yes
46	COL4A4	2328	0.226	0.0890	Yes
47	SSPN	2472	0.212	0.0859	Yes
48	NEBL	2528	0.208	0.0875	Yes
49	TP63	2693	0.194	0.0832	Yes
50	KCNMA1	2740	0.190	0.0854	Yes
51	NOTCH2	2857	0.182	0.0837	Yes
52	VIL1	2861	0.181	0.0881	Yes
53	NEO1	2876	0.180	0.0920	Yes
54	NOVA1	2946	0.175	0.0929	Yes
55	FBLN2	3011	0.172	0.0941	Yes
56	CYLD	3030	0.171	0.0977	Yes
57	CELF2	3039	0.170	0.1019	Yes
58	PIK3CA	3103	0.167	0.1031	Yes
59	ACPL2	3109	0.166	0.1075	Yes
60	GPR22	3117	0.165	0.1117	Yes
61	RHOBTB3	3252	0.157	0.1091	Yes
62	COL4A3	3265	0.157	0.1130	Yes
63	FIGN	3278	0.156	0.1170	Yes
64	TECTA	3418	0.150	0.1141	Yes
65	KCNN3	3517	0.144	0.1134	Yes
66	ITGA8	3526	0.144	0.1176	Yes
67	ZEB2	3554	0.143	0.1208	Yes
68	PIK3R3	3580	0.141	0.1240	Yes
69	SERTAD4	3629	0.139	0.1261	Yes
70	TLE4	3652	0.138	0.1295	Yes
71	PCNX	3702	0.135	0.1315	Yes
72	NOTCH2NL	3713	0.135	0.1356	Yes
73	NFYA	3714	0.135	0.1402	Yes
74	GTPBP1	3797	0.131	0.1404	Yes
75	TBX19	3806	0.130	0.1446	Yes
76	ROBO1	3811	0.130	0.1490	Yes
77	GNB3	3852	0.128	0.1514	Yes
78	PACSIN3	3871	0.128	0.1551	Yes
79	LMX1A	3885	0.127	0.1590	Yes
80	LUC7L3	3888	0.127	0.1635	Yes
81	ARID3B	3920	0.126	0.1665	Yes
82	TNRC6A	4073	0.119	0.1628	Yes
83	PRRX1	4109	0.118	0.1656	Yes
84	RARB	4111	0.118	0.1702	Yes
85	SEMA3C	4757	0.096	0.1398	No
86	DACH1	4789	0.095	0.1427	No
87	ZBTB20	5045	0.087	0.1335	No
88	UNC5B	5080	0.087	0.1363	No
89	TAF2	5203	0.083	0.1343	No
90	PCMTD1	5294	0.081	0.1340	No
91	MID1	5329	0.080	0.1368	No
92	NRP1	5567	0.073	0.1286	No
93	STX7	5752	0.068	0.1232	No
94	HERPUD2	5816	0.067	0.1244	No
95	KLHL5	6005	0.062	0.1188	No
96	PCNT	6006	0.062	0.1235	No
97	CASZ1	6067	0.061	0.1248	No
98	MBNL1	6126	0.059	0.1263	No
99	SUPT6H	6137	0.059	0.1304	No
100	NRL	6149	0.059	0.1344	No
101	PRKAB1	6179	0.058	0.1375	No
102	C22orf26	6244	0.057	0.1386	No
103	KLF7	6426	0.052	0.1334	No
104	BAZ1A	6451	0.051	0.1368	No
105	TNFSF13B	6611	0.048	0.1328	No
106	FIP1L1	6902	0.042	0.1216	No
107	GRPR	6947	0.041	0.1239	No
108	MARCKS	7068	0.038	0.1220	No
109	LDB2	7578	0.027	0.0990	No
110	TOB1	7636	0.026	0.1005	No
111	TSHZ3	7646	0.026	0.1047	No
112	CADM1	7927	0.021	0.0941	No
113	C16orf52	8005	0.019	0.0945	No
114	NONO	8066	0.018	0.0959	No
115	LMO3	8462	0.010	0.0791	No
116	HESX1	8472	0.010	0.0832	No
117	RAB22A	8485	0.009	0.0872	No
118	PCSK2	8723	0.004	0.0790	No
119	DSG1	8729	0.004	0.0833	No
120	KAT6B	8805	0.003	0.0839	No
121	LRRTM1	8833	0.003	0.0870	No
122	SRSF7	9007	-0.001	0.0823	No
123	EPB41L5	9219	-0.005	0.0754	No
124	SDF2	9229	-0.006	0.0796	No
125	PRKAR2A	9348	-0.008	0.0778	No
126	SRPK2	9491	-0.010	0.0747	No
127	DLL4	9839	-0.018	0.0605	No
128	H3F3B	10020	-0.021	0.0554	No
129	SHOX2	10098	-0.022	0.0558	No
130	FAM193B	10243	-0.025	0.0526	No
131	RREB1	10264	-0.025	0.0562	No
132	XYLT2	10483	-0.030	0.0490	No
133	ZNF366	10560	-0.031	0.0495	No
134	NKX6-1	10598	-0.032	0.0521	No
135	ELMO1	10897	-0.039	0.0405	No
136	SEMA6A	11160	-0.045	0.0309	No
137	RGS12	11594	-0.055	0.0120	No
138	OSR2	11612	-0.056	0.0158	No
139	FKBP5	11625	-0.056	0.0197	No
140	PTPRO	11654	-0.057	0.0228	No
141	SALL3	12045	-0.066	0.0063	No
142	INPPL1	12503	-0.078	-0.0139	No
143	ADRB2	13083	-0.094	-0.0407	No
144	ARHGAP44	13208	-0.099	-0.0428	No
145	LYSMD2	13417	-0.105	-0.0495	No
146	ID3	13510	-0.108	-0.0498	No
147	SLC37A4	13563	-0.110	-0.0480	No
148	KCTD15	13589	-0.111	-0.0448	No
149	ITPR3	13705	-0.116	-0.0464	No
150	TYR	13742	-0.117	-0.0437	No
151	RPA2	13810	-0.120	-0.0427	No
152	CALN1	13849	-0.121	-0.0401	No
153	RBFOX1	13934	-0.125	-0.0401	No
154	EBF2	13975	-0.127	-0.0376	No
155	WNT8B	14314	-0.145	-0.0513	No
156	ADAMTS17	14344	-0.147	-0.0483	No
157	IRX4	14420	-0.150	-0.0477	No
158	LYG2	14547	-0.156	-0.0499	No
159	RGS8	14724	-0.165	-0.0549	No
160	MSX2	14821	-0.173	-0.0555	No
161	RASL10B	14843	-0.174	-0.0520	No
162	JDP2	15001	-0.185	-0.0559	No
163	C1orf122	15055	-0.190	-0.0541	No
164	SULF2	15091	-0.193	-0.0514	No
165	RAPGEFL1	15198	-0.201	-0.0525	No
166	PTH1R	15314	-0.210	-0.0541	No
167	HOXA2	15483	-0.226	-0.0586	No
168	JUNB	15515	-0.230	-0.0557	No
169	NLGN2	15559	-0.233	-0.0534	No
170	SLC24A4	15561	-0.233	-0.0488	No
171	DCT	15776	-0.260	-0.0558	No
172	MTSS1	16046	-0.292	-0.0658	No
173	RORB	16207	-0.318	-0.0698	No
174	ST8SIA3	16249	-0.326	-0.0674	No
175	BHLHE41	16307	-0.336	-0.0659	No
176	LRRC15	16492	-0.375	-0.0713	No
177	PITX2	16527	-0.383	-0.0685	No
178	TBX6	16555	-0.389	-0.0653	No
179	RTN4RL1	16564	-0.392	-0.0611	No
180	GSC	16763	-0.443	-0.0672	No
181	PPP1R1B	16787	-0.449	-0.0639	No
182	OPRM1	16799	-0.453	-0.0598	No
183	RAX	16828	-0.462	-0.0567	No
184	CPA5	16873	-0.471	-0.0545	No
185	WDR49	16891	-0.478	-0.0508	No
186	PPP2R2B	16894	-0.478	-0.0462	No
187	PRL	17016	-0.506	-0.0482	No
188	GNAO1	17058	-0.521	-0.0458	No
189	SIAH3	17162	-0.561	-0.0467	No
190	HOXC6	17200	-0.579	-0.0441	No
191	KRT23	17211	-0.584	-0.0400	No
192	TMEM179	17213	-0.585	-0.0355	No
193	STAC2	17259	-0.607	-0.0333	No
194	HAS2	17361	-0.660	-0.0341	No
195	JPH3	17490	-0.730	-0.0365	No
196	TAC1	17541	-0.761	-0.0345	No
197	KCNH5	17742	-0.913	-0.0408	No
198	BARHL1	17770	-0.940	-0.0376	No
199	HOXD9	17871	-1.011	-0.0384	No
200	CXCL13	17892	-1.034	-0.0349	No
201	ADAM11	17923	-1.059	-0.0319	No
202	SCRT2	17983	-1.112	-0.0304	No
203	MYL1	18027	-1.161	-0.0281	No
204	NEUROD6	18075	-1.212	-0.0261	No
205	SIX1	18109	-1.257	-0.0232	No
206	TRPM8	18111	-1.259	-0.0187	No
207	TBR1	18133	-1.301	-0.0152	No
208	C1orf87	18172	-1.392	-0.0126	No
209	SNTG1	18216	-1.445	-0.0103	No
210	MYF6	18289	-1.558	-0.0096	No
211	LBX1	18292	-1.566	-0.0051	No
212	SP8	18450	-2.175	-0.0090	No
213	FAM169B	18455	-2.195	-0.0045	No
214	MMP27	18521	-3.071	-0.0034	No
215	PHOX2B	18523	-3.145	0.0011	No
216	EN1	18524	-3.181	0.0058	No